分公司开票纳税的流程通常包括以下几个步骤：

税务登记

分公司自领取营业执照之日起三十日内，应持相关证件（如营业执照、税务登记证等）向税务机关申报办理税务登记。

纳税申报

分公司应向所在地的主管税务机关申报纳税。

若分公司为独立核算，需单独申报缴纳增值税。

若总机构和分支机构不在同一县（市），应分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税。

经有权税务机关批准，总机构可以汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。

缴纳税款

分公司应依法缴纳税款。

申领发票

分公司在完成税务登记后，可以向税务局申领发票。

发票开具需遵循税务和会计规定，包括发票管理机构注册、购买方和销售方税务登记证明、发票内容需包含合法字样和税号、金额准确无误，并及时存档以备查验。