办理厂房房产证时，需要缴纳的税费主要包括以下几项：

契税

根据不同时间签订的合同，契税的税率可能有所不同。

1997年10月1日前签署的合同按6%收取，1999年7月30日前签署的合同按3%收取，1999年8月1日后签署的合同，若建筑面积和成交单价满足特定条件，则可能按1.5%收取，否则为3%。

印花税

通常情况下，印花税的税率是房价款的0.05%。

营业税

购买时间在两年内的房屋需缴纳成交价的5%作为营业税。

两年后普通住宅不征收营业税，高档住宅征收买卖差价5%的营业税。

城建税

营业税的7%。

教育费附加税

营业税的3%。

个人所得税

普通住宅2年之内：（售房收入 - 购房总额 - 营业税 - 城建税 - 教育费附加税 - 印花税） × 20%。

2年以上（含）5年以下的普通住宅：（售房收入 - 购房总额 - 印花税） × 20%。

其他费用

可能包括劳务费、登记费、测绘费等，具体费用根据厂房面积和当地标准可能有所不同。

请注意，以上信息仅供参考，具体税费应以当地政府部门的规定为准。建议在办理前咨询当地房产交易中心或相关部门获取最新的税费信息