物业公司进行水费的简易征收可以按照以下步骤进行：

确定销售额

扣除对外支付的自来水水费后的余额作为销售额。

计算增值税

按照简易计税方法，依3%的征收率计算缴纳增值税。

开具发票

可以全额开具增值税普通发票或增值税专用发票。

账务处理

收到水费时：

```

借：银行存款或现金

贷：主营业务收入

贷：应交税费--应交增值税

```

支付水费时：

```

借：主营业务成本

借：应交税费--应交增值税

贷：银行存款或现金

```

缴纳增值税时：

```

借：应交税费--应交增值税

贷：银行存款

```

申请简易征收

向税务局申请简易征收方法。

申报纳税

在增值税纳税申报时，在附表一第12栏填列相关信息。

请确保获取合法有效的凭证，如增值税发票或财政票据，以证明扣除的水费部分。需要注意的是，简易征收方法下，进项税额不能用于抵扣销项税额