抹账协议通常是指三方或多方之间就债务或债权进行相互抵消的协议。在会计处理上，抹账协议的入账流程一般遵循以下步骤：

原始凭证收集

收集抹账协议中涉及的原始凭证，如合同、发票、银行转账记录等。

编制记账凭证

根据收集到的原始凭证编制记账凭证，记录抹账协议中的经济业务。

科目汇总

根据记账凭证编制科目汇总表，汇总涉及的会计科目及其金额。

会计账簿登记

根据记账凭证和科目汇总表登记会计账簿，详细记录每笔抹账业务。

会计报表编制

根据会计账簿（主要是总账）编制会计报表，如资产负债表、利润表等。

纳税申报表编制

根据会计报表编制纳税申报表，反映抹账协议对税收的影响。

年终结转

年终进行损益结转，将本年度的利润或亏损转入未分配利润或亏损账户。

年度会计报表编制

编制年度会计报表，汇总一年的财务数据。

所得税申报

根据年度会计报表编制所得税年报和其他各税种的汇算清缴自查表，进行税务申报。

以上步骤确保了抹账协议在会计上的准确反映和处理。需要注意的是，具体的会计处理可能因企业的会计政策和所在国家的会计准则而有所不同。