工程预开票的开票流程通常包括以下几个步骤：

办理外经证

登录企业电子税务局，选择“我要办税” ->

“综合信息报告” ->

“税源信息报告” ->

“跨区域涉税事项报告”。

根据合同信息填写报告并提交，完成外经证的办理。

预缴税款

携带工程合同原件及复印件、分包合同原件及复印件、分包发票原件及复印件等资料。

到施工项目所在地的主管税务机关，填写《增值税预缴税款表》，并缴纳应预缴的增值税额。

开具发票

登录企业电子税务局，进入开票界面，选择建筑服务特定业务，填写相关发票信息，并开具发票。

注意发票备注栏需填写项目所在的地市县及项目名称。

核销外经证

项目结束后，持相关资料到机构所在地税务机关核销外经证。

请根据具体情况灵活处理，并确保遵守当地税务规定和流程。