厂房整改费用应根据具体情况计入不同的会计科目：

1. 如果整改费用金额较大，并且满足固定资产大修理支出的条件（即修理支出达到固定资产计税基础的50%以上，且修理后使用年限延长2年以上），则应计入长期待摊费用科目。

2. 如果整改费用金额特别大，影响到固定资产的原值，则应先计入在建工程科目，完工后结转到固定资产科目。

账务处理示例：

计入长期待摊费用：

```

借：长期待摊费用

贷：银行存款等科目

```

计入在建工程：

```

借：在建工程

贷：银行存款等科目

```

完工后转入固定资产：

```

借：固定资产

贷：在建工程

```

请根据您的具体情况选择合适的会计科目进行核算