建筑分包企业在进行纳税申报时，应遵循以下步骤：

税务登记

在税务机关办理税务登记，取得税务登记证。

选择税种

根据分包业务性质，选择适用的税种，如增值税、企业所得税等。

准备申报资料

包括发票、合同、成本费用凭证等，确保资料真实、完整。

填写纳税申报表

根据选择的税种，填写相应的纳税申报表，如增值税申报表、企业所得税申报表等。

提交申报资料

将填写好的纳税申报表及相关资料提交给税务机关。

纳税

税务机关审核申报资料后，根据税法规定计算税款，分包企业按时缴纳税款。

税务机关审核

税务机关对申报资料进行审核，如有问题，将通知分包企业进行更正。

税收优惠

分包企业符合税收优惠政策条件的，可申请享受相应优惠。

请注意，建筑工程分包方在缴税时，应以取得的全部价款和价外费用扣除支付给其他单位的分包款后的余额为营业额，并需缴纳增值税、教育费附加、城建税、地方教育费、印花税等。

以上步骤和规定基于最新的税法和相关通知，具体操作可能因地区和政策更新而有所变化。建议联系当地税务机关或咨询专业税务顾问获取最新信息