收到6%税率的增值税专用发票时，您可以按照以下步骤进行抵扣：

确认发票类型：

确保收到的发票为增值税专用发票，并且具有抵扣联。

认证发票：

在规定的期限内，对发票进行认证，以证明其合法性和有效性。

抵扣进项税：

根据发票上标注的税额（即6%的税率计算出的税金）进行进项税的抵扣。

遵守规定：

确保抵扣的操作符合当地税务机关的规定和要求。

请注意，抵扣的具体操作可能因地区和企业具体情况而有所不同，建议咨询专业的税务顾问或当地税务机关以获得最准确的指导