付款给A公司的步骤通常包括以下几个环节：

开具收款凭证

当个人转账给A公司100万时，首先需要开具个人转账收款凭证。

凭证上应注明收款人是A公司，支付日期、转账金额、付款人及付款账号、付款银行等信息。

入账处理

收到个人转账款项后，A公司应将其记入未入账款项，并进行登记确认。

开具付款凭证

A公司需要开具付款凭证，注明付款金额、收款人（即A公司自身）以及A公司的公户账号、收款银行等信息。

提取款项并付款

从总账中提取100万元款项，然后付给A公司。

在现金流量表上也应记录付款信息。

此外，如果涉及到委托第三方付款的情况，例如通过委托书委托A公司付款，可能还需要以下步骤：

准备一份委托书，证明委托付款的事实。

在委托书中注明被委托方（A公司）及委托事项。

根据具体情况，可能还需要三方盖章以确认委托付款的合法性和有效性。