药店在记账时需要注意以下几个方面：

收入记录

记录药品销售收入，包括药品名称、数量、单价及总价。

对于医保报销等收入，也应详细记录。

支出记录

记录药品采购成本、员工工资、租金、水电费、管理费、卫生费等日常运营开支。

对于采购退货，也应记录对应的采购成本和进项税额。

利润计算

利润等于收入减去支出。

税务处理

遵守相关税务法规，及时申报纳税。

记录增值税、所得税等。

账务核对

定期进行库存盘点，确保账实相符。

进行月度或季度的财务分析，了解财务状况。

使用财务管理软件 （可选）：

提高财务管理效率。

具体的会计分录示例（以增值税为例）：

采购环节

```

借：库存商品

贷：银行存款

```

销售环节：

```

借：库存现金（或银行存款等）

贷：主营业务收入

```

请根据实际业务情况调整会计分录，并确保所有凭证齐全，每一笔交易都有相应的发票或收据作为支持。