公车拍卖的入账纳税处理可以按照以下步骤进行：

会计处理

将公车拍卖收入记入“银行存款”或“库存现金”账户。

根据固定资产清理、累计折旧等相关科目进行会计处理。

如果拍卖收入属于应缴款项，则不计入行政事业单位的收入。

税务处理

根据增值税的相关规定，需要计算缴纳增值税。

如果拍卖有净收益，需要计入利润总额缴纳企业所得税。

对于二手车交易，需要开具二手车交易发票，并按规定缴纳增值税。

拍卖收入应扣除相关税费后全部上缴国库。

根据《财政部、国家税务总局关于简并增值税征收率政策的通知》（财税〔2014〕57号），增值税征收率可能会有所调整。

其他注意事项

根据《深圳市直机关公务用车改革车辆拍卖办法》，买受人需要在规定时间内支付成交价款及相关税费。

拍卖收入若直接足额缴入财政国库，可能不需要缴纳增值税。

对于买受人承担的税费，各省市执行可能不同，需要根据当地规定执行。

请根据具体情况，结合当地税法和会计规定，进行详细的账务处理和税务申报。