运费收入的会计处理取决于企业是否主营运输业务。以下是具体的会计处理方法：

主营运输企业

收入确认：收到的运费应计入主营业务收入。

会计分录：

```

借：银行存款/应收账款

贷：主营业务收入

贷：应交税费-应交增值税（销项税额）

```

非主营运输企业

收入确认：收到的运费应计入其他业务收入。

会计分录：

```

借：银行存款/应收账款

贷：其他业务收入

贷：应交税费-应交增值税（销项税额）

```

其他注意事项

如果运费与销售活动直接相关，则可能计入销售费用。

如果运费与管理活动直接相关，则可能计入管理费用。

如果运费与原材料购买直接相关，则可能计入原材料成本。

对于支付给第三方的运费，如果是代垫费用，则应记入应收账款科目。

请根据您的具体情况选择合适的会计处理方法。