可以认证抵扣的发票主要包括以下几种：

增值税专用发票：

由增值税一般纳税人开具，购买方企业收到后可通过税务部门的认证系统验证其有效性，并用于抵扣进项税额。

海关进口增值税专用缴款书：

企业在进口货物时缴纳增值税后取得，可作为增值税的抵扣凭证。

农产品收购发票：

农产品收购企业向农业生产者个人收购自产农产品时开具，注明增值税额可用于抵扣。

农产品销售发票：

农产品销售企业开具，同样可以用于抵扣进项税额。

货物运输业统一发票：

部分实施营改增地区的运输业增值税发票。

代扣代缴税款的完税凭证：

如某些税款已由他人代扣代缴，纳税人取得的完税凭证也可用于抵扣。

诉讼费发票：

某些情况下，诉讼费发票也可能被允许用于抵扣。

发票的认证和抵扣需要满足一定条件，如发票必须在规定时间内完成认证，且必须完整无损，所有必要信息齐全。此外，对于某些特定的发票，如防伪税控系统开具的增值税专用发票，必须在开具之日起180日内完成认证，否则无法抵扣进项税额。

需要注意的是，小规模纳税人通常不允许抵扣进项税额。