当一般纳税人从农户采购农产品时，抵扣进项税额通常有以下几种方式：

凭票抵扣

从一般纳税人处购进农产品，取得增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书，可以直接按票面税额抵扣。

从小规模纳税人处购进农产品，取得征收率为3%的增值税专用发票，按发票金额乘以9%的扣除率计算抵扣。

向农业生产者（农户）购进免税农产品，可取得免税销售发票，按发票金额乘以9%的扣除率计算抵扣。

若农业生产者未开具发票，可自行开具农产品收购发票，按发票金额乘以9%的扣除率计算抵扣。

核定抵扣（核定扣除）

向农业生产者购进自产农产品，可凭农副产品收购发票或自产农副产品销售发票抵扣进项税额。

若用于生产13%税率货物，可在购进时扣除9%的基础上，在生产领用农产品的当期加计抵扣1%，即扣除率为10%。

其他情形

向农户收购农产品，由收购单位开具发票，按收购单位开具的农产品收购发票上注明的金额和规定的扣除率计算抵扣。

若购买方直接向农业生产者购进农产品，可凭借农产品销售发票或农产品收购发票进行抵扣。

对于购进流通环节征税的农产品，若销售方是一般纳税人，可凭增值税专用发票抵扣；若销售方是小规模纳税人，可凭3%或1%征收率的专用发票抵扣。