当企业支付水电费但没有收到发票时，可以采用以下几种方法进行账务处理：

使用收据和协议复印件

如果费用是由物业代收，可以要求物业提供支付给供应商的票据复印件和代垫电费的收据作为入账依据。

如果电费是企业的全部，附上收据、发票复印件和当初的协议复印件即可入账。

核定成本法

对于支出比较固定且金额不大的水电费，企业可以按照往年水电费的支出金额进行核定，将该费用算作成本，记在相应的成本账户中。

以其他凭证代替

使用水电表读数、水电费缴纳凭证等作为支出凭证记账。

会计分录处理

在费用发生时，按企业实际支付的费用计入到对应的科目，例如：

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借：管理费用—水电费

贷：银行存款等

```

在企业所得税汇算清缴时，需要对没有发票的水电费支出做纳税调增应纳税所得额处理。

请注意，以上方法需要确保相关凭证的完整性和合规性，并符合当地税务规定。如果企业有明确的规定必须凭发票报销，则可能需要按照企业的《费用报销制度》进行操作。