工程异地经营时，企业需要遵循以下步骤进行税务处理：

税务登记

在项目所在地税务局进行税务登记，取得税务登记证。

预缴税款

根据项目所在地适用的税率进行纳税申报，通常包括增值税、企业所得税等。

增值税预缴：根据是否为一般纳税人或小规模纳税人，以及是否适用简易征收方法，有不同的预缴计算方法。

企业所得税：跨地区异地施工，按项目实际经营收入的0.2%，按月或按季向项目所在地主管税务局预缴企业所得税。

纳税申报

在企业所在地进行纳税申报。

总承包企业、分承包企业等应代扣代缴个人所得税并向工程作业所在地税务机关申报缴纳。

相关证明

办理《外出经营活动税收管理证明》（简称《外管证》），并在施工地预缴税款。

其他税费

根据项目合同约定，缴纳项目所在地的地方税费，如城市维护建设税、教育费附加等。

注意事项