在两地发放工资时，合理避税可以通过以下方法进行：

利用税收政策差异

了解并对比两地的个税起征点、税率结构及专项扣除项目，合理规划工资分配比例。

合理规划工资发放

避免将不该交税的部分计入工资，如电话费、外地补助等实际发生费用，通过报销方式处理。

工资发放应均衡，避免因一次性大额收入导致交税档次提高。

利用税收优惠政策

在“税收洼地”注册个人独资企业，享受税收优惠，如免征企业所得税，仅缴纳增值税和个人所得税。

提高职工福利

提供住所、假期旅游津贴、购买保险公司的理财险等，降低名义收入。

企业提供员工福利设施，如免费午餐、医疗福利、交通工具等。

推迟或提前领取劳动报酬

通过分期领取劳动报酬，将收入分摊到更长的时间内，降低每月的应纳税额。

其他合法合规方式

调整收入类型，如将部分收入转化为非应税所得，如通过设立合法合规的报销制度。

请注意，避税必须遵守当地法律法规，避免采取任何违法或不道德的手段。以上信息仅供参考，具体操作请咨询专业税务顾问或律师