当企业遇到库存商品丢失的情况，以下是会计处理的步骤和相应的会计分录：

确认丢失事实

首先确认商品丢失的事实，并收集相关证据。

会计分录

发现库存商品丢失时，未查明原因，会计分录为：

```

借：待处理财产损溢

贷：库存商品

```

报经批准后，对于应由过失人赔偿的损失，会计分录为：

```

借：其他应收款——XXX

贷：待处理财产损溢

```

如果用工资来抵账，会计分录为：

```

借：应付职工薪酬——XXX

贷：其他应收款——XXX

```

查明原因后的处理

如果丢失是由于天灾人祸等不可抗力因素，会计分录为：

```

借：管理费用/营业外支出

贷：库存商品

```

如果丢失是由于员工盗窃等人为原因，会计分录为：

```

借：其他应收款/管理费用等

贷：待处理财产损溢

```

税务处理

根据《增值税暂行条例》，购进货物发生非正常损失时，应将进项税额转出。

增值税进项税额转出分录为：

```

借：待处理财产损溢

贷：应交税费——应交增值税（进项税额转出）

```

期末处理

每期末将“库存损失”科目余额转入“本年利润”科目：

```

借：本年利润

贷：库存损失

```

请根据具体情况选择合适的会计处理方法，并确保所有会计分录都符合企业会计政策和相关税法规定。