软件代理费的记账方法如下：

核对收款凭证

确保收到的代理费金额准确无误。

记入财务科目

软件代理费收入通常记入“管理费用”科目。

如果是预收款项，则按规定处理。

计算并缴纳相关税费

根据软件代理费的性质，可能需要缴纳增值税或其他相关税费。

增值税的计算和缴纳应根据当地税法规定执行。

财务报表列示

在财务报表中正确列示软件代理费收入及相关税费。

使用会计软件

利用会计软件如用友畅捷通的好会计，可以自动化记账，自动识别并分类费用，确保账目准确性。

开具发票

如果代理费是企业收入的一部分，需要向对方开具发票。

请根据具体情况调整会计分录，并确保遵循当地会计准则和税法规定。