药店作为小规模纳税人，在购进药品时的会计入账流程如下：

取得发票：

首先需要从销售方获取正规的发票，这可以是增值税专用发票或普通发票。

录入会计系统：

将发票上的信息，包括药品名称、规格、数量、单价、金额等，录入会计系统。

创建会计分录：

在会计系统中创建一笔“购进药品”的会计分录。

如果是现购药品，借方账户为“库存药品”或“低值易耗品”，贷方账户为“银行存款”。

如果是赊购药品，借方账户为“库存药品”或“低值易耗品”，贷方账户为“应付账款”。

定期盘点：

定期进行库存盘点，确保账实相符，如有差异，及时查找原因并进行调整。

税务处理：

小规模纳税人购进药品时，取得的增值税发票上注明的增值税不予抵扣，应直接计入相关成本费用或资产。

无票进货：

如果药店进行无票进货，应记录进货明细，并自行制作凭证。根据国家税务局的规定，小规模纳税人可以选择简化征收或差额征收方法缴纳增值税。

请确保在记账过程中遵循国家相关会计制度和税务规定，真实、准确、完整地记录药品购进情况