免税收入的纳税申报流程通常包括以下几个步骤：

确认免税资格

确认收入是否符合免税条件，如是否属于国家规定的免征增值税或所得税的收入范围。

计算免税收入

根据税法规定，将免税收入从应纳税所得额中减除，从而减少应纳税额。

填写申报表格

个人填写个人所得税申报表，企业填写企业所得税年度纳税申报表。

在相应的栏目中填写免税收入的具体金额。

提交申报材料

个人将个人所得税申报表及相关证明材料提交至当地税务机关。

企业将企业所得税年度纳税申报表及相关证明材料提交至主管税务机关。

审核及确认

税务机关对申报材料进行审核，如发现问题或需要补充材料，则通知申报人进行补正。

审核通过后，税务机关会确认免税收入，从而减少纳税额。