根据最新的税法规定，佣金开票的税率取决于企业的纳税人身份：

一般纳税人的增值税税率为6%。

增值税小规模纳税人的增值税征收率为3%。

此外，还需注意以下事项：

如果员工佣金不开票，而是直接计入工资薪金核算个税，则不适用上述的增值税税率。

增值税的征收可能受到特定时期政策的影响，例如疫情期间可能会有所调整。

除了增值税，还需缴纳相应的附加税费，并且支付方可能需要按照不含税佣金收入扣缴劳务报酬个人所得税，税率通常在20%-40%之间。

请根据您的具体情况选择合适的税率，并考虑最新的税法规定和地方政策。