当公司承担员工的个人所得税时，会计处理通常包括以下几个步骤：

计提个人所得税

借：应付职工薪酬-工资

贷：应交税费-个人所得税

缴纳个人所得税

借：应交税费-个人所得税

贷：银行存款

发放工资

借：库存现金/银行存款

贷：应付职工薪酬-职工工资

支付个人所得税

借：应交税费-个人所得税

贷：库存现金/银行存款

请注意，这些步骤需要遵守相关的税法规定，并且可能需要根据公司的具体情况和当地税务部门的要求进行调整。会计分录应准确反映公司的财务状况，并准备相应的凭证材料以支持企业的财务活动。