企业可能面临的税务问题包括但不限于以下几点：

税负率异常：

企业的税负率与同行业相比明显偏高或偏低，可能会引起税务机关的注意。

零申报与开票金额不符：

连续零申报或申报收入与开票金额不一致可能被视为隐瞒收入或虚开发票。

发票管理问题：

发票获取、使用与记录不符合规定，可能会被税务部门关注。

大数据分析风险：

税务机关利用大数据分析评估企业税务风险，异常指标可能导致企业被列入稽查名单。

进项抵扣问题：

农副产品进项抵扣等特定税务处理不当可能引发问题。

增值税问题：

商品和服务分类错误、进项税额抵扣不当等。

企业所得税问题：

应纳税所得额计算错误、税收优惠应用不当等。

个人所得税问题：

员工工资、奖金、福利个税代扣代缴不当，股东分红个税处理问题。

关税与进出口税问题：

进出口业务相关的关税政策不了解，报关及税费缴纳流程不明确。

地方税种问题：

对地方特定税种如城市维护建设税、教育费附加等理解不足。