公司缴纳住房公积金的流程通常包括以下几个步骤：

签订协议：

企业与当地住房公积金管理中心签订公积金管理协议，明确双方的权利和义务。

确定比例：

根据当地规定，确定员工和企业的公积金缴费比例，通常员工缴纳比例为6%-12%，企业缴纳比例为8%-12%。

登录系统：

企业通过住房公积金管理中心的网站或手机App登录公积金管理系统。

缴纳公积金：

在系统中填写员工缴费信息，并通过银行转账等方式将公积金缴纳到指定账户。

申报公积金：

每月15日之前，企业需将当月公积金缴费信息申报给住房公积金管理中心。

办理汇缴：

单位专管员填写《住房公积金汇缴书》，送达银行窗口，经审核后办理汇缴，银行出具回单联作为财务凭证。

备案：

新企业成立后30日内，需到公积金中心办理缴存登记和员工信息备案，员工可在金融机构申请办理公积金账号。

缴纳基数：

公积金的缴费基数通常是职工上一年度的月平均工资，且不得低于当地社平工资的60%，不得高于300%。

缴纳比例：

单位和职工缴存比例均不得低于5%，原则上不超过12%，单位可根据经营状况确定缴存比例。

月缴存额计算：

以每个职工的月缴存基数乘以单位和个人的缴存比例，计算出每个职工的月缴存额。

请注意，以上流程可能因地区政策不同而有所差异，具体操作应遵循当地住房公积金管理中心的规定。