跨区域涉税预缴的税款主要包括以下几种：

增值税

一般纳税人提供建筑服务，适用一般计税方法时，按2%预征率预缴增值税。

一般纳税人提供建筑服务，选择简易计税方法时，按3%征收率预缴增值税。

小规模纳税人提供建筑服务，按3%征收率预缴增值税。

城建税、教育费附加、地方教育费附加

通常与增值税一起预缴。

企业所得税

建筑企业总机构直接管理的跨地区项目部，按项目实际经营收入的0.2%预缴企业所得税。

个人所得税

可能需要根据当地规定预缴。

印花税

根据合同类型和金额预缴。

请注意，具体的税率和预缴方法可能因地区而异，建议咨询当地税务机关获取最准确的信息