企业补缴的增值税应该记在“应交税费”科目下的“未交增值税”子科目中。具体的会计分录如下：

```

借：应交税费——未交增值税

贷：银行存款

```

这个会计分录反映了企业补缴了之前未缴纳的增值税，增加了企业的负债，并减少了相应的银行存款余额。

如果补缴的是以前年度的增值税，会计处理可能会有所不同，需要根据具体情况调整会计分录。例如，如果是以前年度查账补交，可能涉及以下分录：

```

1. 计提时

借：以前年度损益调整

贷：应交税费——增值税检查调整

2. 查补转出

借：应交税费——增值税检查调整

贷：应交税费——未交增值税

3. 补交增值税

借：应交税费——未交增值税

贷：银行存款

4. 结转损益调整

借：利润分配——未分配利润

贷：以前年度损益调整

```

请根据企业的实际情况和适用的会计准则进行会计处理