汽车发票的抵扣联主要用于税务抵扣，具体作用如下：

抵扣销项税额：

抵扣联是企业认证进项税额、抵扣销项税额的合法凭证。

税务认证：

购买方（一般纳税人）可以将抵扣联拿到国税局进行认证，认证通过后可作为企业当期的进项税额进行抵扣。

发票真伪确认：

通过对发票密码区的密码解密，还原发票的真实业务，并与发票开具方报出的防伪税控信息进行比对，以确认发票的真伪。

机动车购买凭证：

抵扣联也是购车单位付款的凭证，是购车交易的重要组成部分。

请注意，如果购买者是自然人，抵扣联通常没有作用，因为自然人一般不是一般纳税人，不适用于进项税额的抵扣。此外，小微企业如果不符合抵扣条件，其抵扣联也是没有用的