短信扣款应该计入财务费用科目。具体会计分录如下：

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借：财务费用-金融机构手续费

贷：银行存款

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财务费用科目用于核算企业为筹集生产经营所需资金等而发生的筹资费用，其中包括利息支出（减利息收入）、汇兑损益以及相关的手续费等。月末结转时，可以将财务费用转入本年利润科目：

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借：本年利润

贷：财务费用-手续费

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需要注意的是，根据不同的会计政策和实际情况，可能会有所不同。