医保扣款的入账方式通常遵循以下步骤：

缴纳时

对于单位部分和个人部分的医保费用，分别计入不同的账户。

单位部分计入应付职工薪酬--社会保险费（单位部分），个人部分计入其他应收（付）款--社会保险费（个人部分）。

同时贷记银行存款账户。

计提时

单位部分的社会保险费计入管理费用--社会保险费（单位部分）。

贷记应付职工薪酬--社会保险费（单位部分）。

发放工资时

将应由个人承担的社会保险费从工资中扣除，并计入其他应收（付）款--社会保险费（个人部分）。

同时贷记库存现金（实发数）或银行存款账户。

支付时

当实际支付医保费用时，借记其他应付款--医疗保险（大病统筹）等账户。