代理认证的费用通常应计入“管理费用”科目。具体来说，如果认证费用是作为服务费支付，则应记入“管理费用-服务费”这一会计科目。如果认证费用是通过银行存款等方式支付的，相应的会计分录可能如下：

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借：管理费用-服务费

贷：银行存款

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此外，根据认证的具体内容，可能还会有更详细的明细科目，例如“管理费用—ISO费用”或“管理费用—产品质量认证费用”等。

需要注意的是，管理费用属于期间费用，在发生的当期就应计入当期的损益。