运输公司在设置账簿时需要考虑以下几种主要账簿：

总账：

用于记录企业的所有财务交易，反映企业的财务状况。

明细账：

详细记录各项经济业务，如运输收入、成本、费用等。

日记账：

按时间顺序记录现金和银行存款的收支情况。

现金日记账：

记录每日现金的收入和支出。

银行存款日记账：

记录银行存款的收支情况。

应收账款明细账：

记录应收款项的详细情况。

应付账款明细账：

记录应付款项的详细情况。

固定资产明细账：

记录固定资产的详细情况，包括车辆、设备等。

销售明细账：

记录销售活动的收入和相关成本。

生产成本明细账：

记录生产过程中的成本。