股权转让款的记账方法如下：

根据股权转让协议入账

```

借：实收资本——原股东

贷：实收资本——新股东

```

这个会计分录反映了公司股东结构的变更，即原股东将其股权转让给新股东，公司在会计记录上需相应调整实收资本的归属。

通过公司账户进行交易

新股东交款时：

```

借：银行存款（或库存现金）

贷：其他应付款——代收股权转让款

```

支付原股东时：

```

借：其他应付款——代收股权转让款

贷：银行存款（或库存现金）

```

当新股东通过公司账户支付股权转让款时，公司首先将该款项视为代收款项计入“其他应付款”科目；随后，当公司向原股东支付该款项时，再从“其他应付款”科目转出至“银行存款”或“库存现金”科目。

特殊情况处理

受让方股款一次到位：

```

借：银行存款

贷：其他应付款——出让方

借：实收资本（或股本）——出让方

贷：实收资本（或股本）——受让方

```

涉及个人所得税的处理：

如果出让方为自然人，且转让股款大于出让方原实际出资额时，转让方应承担的个人所得税应由公司代扣代交。

请根据具体的交易情况和会计准则进行操作。