公司缴纳税款的方式通常有以下几种：

按月缴纳

适用于那些需要每月根据实际利润计算税费的纳税人。

按季度缴纳

适用于那些每个季度根据经营情况和实际利润计算税费的纳税人。

年度汇算清缴

在企业年度报表编制完毕后，根据全年的经营情况进行清算，并缴纳相应的税费。

纳税申报流程通常包括：

核算纳税所得额：根据企业财务报表计算纳税所得额。

填写纳税申报表：填写企业所得税纳税申报表，包含基本信息、所得额、应纳税额等。

申报并缴纳税款：将填好的纳税申报表交至税务局，并缴纳应纳税款。

领取缴纳税款证明和发票：从税务机关领取缴纳税款的证明和发票，作为纳税的有效凭证。

公司需要缴纳的税种包括但不限于：

增值税：一般纳税人17%，小规模纳税人3%。