当企业商品入库发生损耗时，会计处理通常遵循以下步骤：

确认损耗

确定损耗的数量和金额，这通常由仓库管理员或生产部门提供报告。

会计分录

若损耗属于合理损耗，则先通过“待处理财产损溢”科目进行核算，确认为合理损耗后，可计入管理费用科目。

若损耗属于非合理损耗，应根据原因不同，可能计入营业外支出、管理费用等科目。

合理损耗的账务处理

记录原料入库价格，并在损耗科目内记录损耗金额。

将损耗科目与原料科目间进行转账，抵消后的金额记录到库存商品科目。

非合理损耗的账务处理

根据造成损耗的原因，可能涉及其他应收款、管理费用——存货损失、营业外支出等科目。

进项的增值税可能需要转出处理。

期末处理

结转管理费用至本年利润科目。

请注意，具体的会计处理可能因企业的具体情况、所在国家的会计准则和法规而有所不同。务必遵循当地的会计准则和法规进行核算。