公司进行税务审计时，通常需要准备以下资料：

1. 营业执照及企业章程

2. 税务登记证（国、地税）

3. 执行的会计制度及相关政策

4. 执行的税种、税率和销售税收优惠政策批件

5. 总账、明细账、会计凭证及相关原始记录

6. 会计报表（包括资产负债表、利润表、利润分配表、现金流量表、所有者权益增减变动表及编表说明等）

7. 纳税申报表及相关纳税资料（如税单、增值税发票等）

8. 报经主管税务机关批准的税前扣除项目相关文件

9. 重要的经营合同及协议（如投资合同、承包合同、借款合同、财产转让协议等）

10. 长期投资及关联企业名单（含被投资单位名称、地址、投资额及所占比例、会计核算办法等）

11. 弥补亏损企业还需提供以前年度亏损额报备表及中介机构鉴证报告

12. 注销税务登记还需要提供前三年会计报表、纳税申报表及纳税情况、会计账册、凭证和发票申购、试用及结存情况

13. 重大经营决策的股东会决议及实施情况