处理工程挂靠问题通常涉及以下步骤和措施：

责令改正

建筑施工企业不得转让、出借资质证书或以其他方式允许他人以本企业名义承揽工程。

没收违法所得

对于违规行为，可没收非法所得。

罚款

根据违规行为的严重性，可处以一定比例的罚款。

停业整顿

违规行为严重时，可责令企业停业整顿。

降低资质等级

违规行为严重时，可降低企业的资质等级。

吊销资质证书

在情节严重的情况下，可吊销资质证书。

民事责任和行政处罚

挂靠人和被挂靠者可能需要承担相应的民事责任和行政处罚。

工程质量纠纷