机器设备的折旧费用通常会计入以下科目：

累计折旧-机器设备：

用于记录机器设备在使用过程中的折旧费用累计金额。

制造费用：

如果折旧费用与生产产品和提供劳务相关，则可能计入制造费用科目。

管理费用：

对于管理部门所使用的固定资产折旧，折旧费用计入管理费用科目。

销售费用：

销售部门所使用的固定资产折旧，折旧费用计入销售费用科目。

在建工程：

自行建造固定资产过程中使用的固定资产折旧，折旧费用计入在建工程成本科目。

其他业务成本：

经营租出的固定资产折旧，折旧费用计入其他业务成本科目。

财务科目“固定资产折旧费”：

对于生产部门机器设备折旧，可能直接计入此科目。

具体的会计分录示例如下：

生产用固定资产折旧：

```

借：制造费用

贷：累计折旧

```

行政管理用固定资产折旧：

```

借：管理费用

贷：累计折旧

```

折旧费用的计算通常基于固定资产的原值和规定的折旧率，通过“累计折旧”科目进行核算。