药品纯利的计算遵循以下步骤和公式：

计算毛利润

毛利润 = 药品售价 - 药品进价

扣除运营成本

从毛利润中扣除运营成本，如人员工资、房租、水电费等。

计算利润总额

利润总额 = 毛利润 - 运营成本

计算所得税

根据适用的所得税率计算应缴纳的税款。

计算纯利润

纯利润 = 利润总额 × （1 - 所得税率）

其中，所得税率根据当地税法规定和企业的适用税率确定。

举例来说，如果一家药店本月销售额为10万元，药品进价为8万元，运营成本为5千元，所得税率为25%，则其纯利润计算如下：

毛利润 = 10万元 - 8万元 = 2万元

利润总额 = 2万元 - 0.5万元 = 1.5万元

纯利润 = 1.5万元 × （1 - 25%） = 1.5万元 × 75% = 1.125万元

因此，该药店的纯利润为1.125万元