证券公司缴纳税款主要包括以下几种：

增值税

一般纳税人适用税率为17%。

小规模纳税人适用税率为4%。

城建税

按增值税的7%缴纳。

教育费附加

按增值税的3%缴纳。

地方教育费附加

按增值税的2%缴纳。

印花税

购销合同按购销金额的万分之三贴花。

账本按5元/本缴纳（每年启用时）。

年度按实收资本与资本公积之和的万分之五缴纳（第一年按全额缴纳，以后按年度增加部分缴纳）。

城镇土地使用税

按实际占用的土地面积缴纳（各地规定不一）。

房产税

按自有房产原值的70%*1.2%缴纳。

车船税

按车辆缴纳（各地规定不一，不同车型税额不同）。

企业所得税

按应纳税所得额（调整以后的利润）缴纳，税率根据所得额不同而不同。

个人所得税

工资薪金所得适用累进税率。

股票交易所得适用比例税率，税率为20%。

其他费用

如过户费、佣金等。

缴税流程通常如下：

增值税和企业所得税向国税局申报缴纳。

其他税种如营业税、教育费附加、地方教育费附加、印花税、城镇土地使用税、房产税、车船税等向地税局申报缴纳。

股票交易所得税由证券公司代扣代缴。

投资者在取得收益后次月的十五日内，需向当地主管税务机关申报并缴纳税款。

请注意，税法规定可能会有更新，具体税率和计算方法请以最新的官方通知为准。