当银行回单金额少于应入账金额时，通常意味着客户没有全额付款。这种情况下，您可以按照实际收到的银行回单金额进行入账，并将未收到的款项继续挂在应收账款科目下，以便日后继续追讨。以下是具体的调账步骤：

核对账目

核对银行存款日记账与银行对账单，确认是否有漏记或错记的款项。

处理漏记

如果发现有漏记的回单，需要到银行重新打印出漏记的回单。

然后重新补登银行存款日记账以及相关会计分录。

处理错记

如果是错记的情况，首先制作一笔冲红凭证，注明冲回的日期、凭证号等信息。

然后制作一笔正确的会计凭证以纠正错误。

记录调整

在调整凭证上清晰记录调账的金额和原因。

确保账务处理符合会计原则和法规要求。

审计和记录

经过上述调整后，确保银行存款日记账余额与银行对账单余额一致。

调整过程应有详细的记录和审计轨迹，以备后续查证。

请根据具体情况选择合适的调账方法，并确保所有调整都有合理的解释和文档支持。