微企业在运营过程中需要缴纳的税种主要包括：

增值税：

根据企业的经营范围和销售额，增值税的税率可能为6%、11%或16%。

附加税：

包括城市维护建设税、教育费附加和地方教育费附加，这些税费通常是根据增值税的一定比例征收。

企业所得税：

根据企业的净利润计算，一般企业所得税的税率为25%。

其他税种：

可能包括资源税、房产税、城镇土地使用税、印花税（不含证券交易印花税）、耕地占用税等。

对于小型微利企业，根据最新的税收优惠政策，可能享有一些减免，例如：

月销售额10万元以下（含本数）的增值税小规模纳税人免征增值税。

对小型微利企业减按25%计算应纳税所得额，并按20%的税率缴纳企业所得税。

对增值税小规模纳税人、小型微利企业和个体工商户减半征收资源税、城市维护建设税、房产税、城镇土地使用税、印花税（不含证券交易印花税）、耕地占用税和教育费附加、地方教育附加。

请注意，税收政策可能会有更新和变化，具体情况建议咨询当地税务部门或专业税务顾问以获得最准确的信息