企业年金个人所得税的计算方法如下：

个人缴费部分

个人根据国家政策规定缴付的年金个人缴费部分，在不超过本人缴费工资计税基数的4%标准内的部分，可以暂从个人当期的应纳税所得额中扣除。

企业缴费部分

企业和事业单位为职工缴付的企业年金单位缴费部分，在计入个人账户时，个人暂不缴纳个人所得税。

超出部分的处理

如果个人缴费部分和企业缴费部分的总和超过上述标准，那么超出部分应并入个人当期的工资、薪金所得，依法计征个人所得税。税款由建立年金的单位代扣代缴，并向主管税务机关申报解缴。

领取年金时的个税计算

个人达到国家规定的退休年龄后按月领取的年金，全额按照“工资、薪金所得”项目适用的税率计征个人所得税。

如果按年或按季领取年金，则将年金平均分摊到各月，每月领取额按照“工资、薪金所得”项目适用的税率计算纳税。

其他特殊情况

对于个人因出境定居而一次性领取的年金，或个人死亡后指定受益人或法定继承人一次性领取的年金个人账户余额，适用综合所得税率表计算纳税。

除上述特殊情况外，个人一次性领取年金个人账户资金或余额的，适用月度税率表计算纳税。