税务函调的程序通常包括以下几个步骤：

确定调查对象和内容：

税务部门根据税收法规和政策要求，确定需要调查的企业及其税务事项。

撰写税务函件：

税务部门撰写税务函件，明确调查的目的、内容、要求和时限。

送达税务函件：

税务部门将税务函件送达企业，企业收到函件后需按要求提供相关资料。

提供相关资料：

企业按照要求提供相关资料，可能包括财务报表、纳税申报表、相关证明材料等。

审核和分析资料：

税务部门收到企业提供的资料后进行审核和分析，了解企业的实际税收情况。

税收指导或处理：

税务部门根据调查结果，对企业进行税收指导或处理。

此外，对于调取纳税人或扣缴义务人的账簿、记账凭证等资料，有特定的规定和程序，例如：

调取当年资料时应由设区的市、自治州以上税务局局长批准，并在30日内退还。

调取以前会计年度资料时应由县以上税务局局长批准，并在3个月内完整退还。

提取证据材料原件应向当事人出具专用收据，并在检查结束后及时退还。