汽车客运公司需要缴纳的税种主要包括：

增值税：

根据《增值税暂行条例》，汽车客运公司提供的服务如货物运输、旅客运输等属于增值税征税范围。税率可能因纳税人类型（一般纳税人、小规模纳税人）而异。

企业所得税：

根据《企业所得税法》，汽车客运公司作为企业法人，其所得需要缴纳企业所得税。税率通常为25%，但可能根据公司具体情况有所不同。

个人所得税：

汽车客运公司的员工需要缴纳个人所得税，税率根据收入额度和个人居民身份确定。

印花税：

涉及借款合同、财产保险合同、财产租赁合同等，需按合同金额的一定比率缴纳。

城市维护建设税：

基于营业税税额的一定比例征收。

教育费附加：

基于营业税税额的一定比例征收。

房产税：

根据房产的原值或租金收入计算缴纳。

土地使用税：

根据土地使用面积和等级缴纳。

请注意，税率可能会根据最新的税法和政策调整而有所变化，具体情况应以当地税务部门的规定为准。