公司申请孔雀计划的基本流程如下：

确定区域和社保

确定公司所在的区域，并在该区域购买社保，确保社保缴纳记录连续三个月以上。

学历认证

进行教育部海外学历认证，通常需要约20个工作日。

完成教育部学历认证后，申请深圳市留学人员资格认定，在深圳市人社局官网进行，大约需要5个工作日。

深圳市高层次人才认定

在深圳市人社局官网找到高层次人才申报系统，按要求提交申请。

需要提供三年以上的合同和三个月以上的社保缴纳记录，此步骤需要公司批准。

材料准备齐全后，到人才园窗口办理，通常需要至少两到三趟，因为材料可能因小细节问题而不合格。

从受理到拿到证书大约需要两个月或以上。

补贴申请

认定完成后，需要申请补贴，补贴申请与认定过程在同一个系统进行。

需要提供自证书发放起三个月的个人完税证明和住建局出具的未享受购房优惠情况证明（此材料自2020年8月起已取消，申请时直接选择住建局提供即可）。