会计长短款的处理方法如下：

现金短款

初始处理

借：待处理财产损溢

贷：库存现金

查明原因后的处理

如果短款应由个人赔偿，则：

借：其他应收款-XXX（责任人赔偿）

贷：待处理财产损溢

如果短款原因无法查明，则：

借：管理费用

贷：待处理财产损溢

现金长款

初始处理

借：库存现金

贷：待处理财产损溢

查明原因后的处理

如果长款应支付给其他单位或个人，则：

借：待处理财产损溢

贷：其他应付款-XXX（应支付款项）

如果长款原因无法查明，则：

借：待处理财产损溢

贷：营业外收入

注意事项