当税率下调后，抵扣进项税额应遵循以下步骤进行：

确认认证期限

确保在规定的认证期限内（开具之日起360天内）对进项发票进行认证。

进项税额的计算

对于农产品收购发票，使用发票上注明的货物金额乘以新的税率（如13%）作为进项税额。

会计处理

在会计账目中，将货物成本记为发票金额减去抵扣的进项税额。

示例会计分录：

```

借：原材料等 发票注明金额 x （1 - 新税率）

贷：银行存款 发票注明金额 x 新税率

```

申报表填写

在增值税申报表中，将抵扣的进项税额填写在相应的栏次，如增值税申报表附表二第1、2、35栏次。

红冲与开票

如发生销货退回、开票有误等情况，应按照原税率开具红字发票进行红冲。

特殊规定

对于购进用于生产或加工13%税率货物的农产品，可以按照10%的扣除率计算进项税额。

请根据最新的税法规定和实施细则进行操作，并注意税局发布的最新公告或通知，因为税法可能会有更新或变动。如果有任何疑问，建议咨询专业的税务顾问或直接联系当地税务机关