超市作为纳税人，根据其规模、是否申请一般纳税人资格认定以及当地税务规定，有不同的缴税方式：

小规模纳税人

按营业额的3%缴纳增值税。

按个体工商业户根据当地平均定额标准缴纳增值税。

一般纳税人

按销售收入的17%计提销项税。

可以抵扣购进货物的进项税。

城建税通常按增值税的7%缴纳。

教育费附加通常按增值税的3%缴纳。

税务登记与申报

领取工商营业执照后三十日内，需向主管税务机关申报办理税务登记。

按月、季、年等方式定期申报并缴纳税款。

其他税种

消费税、印花税、营业税、企业所得税等也需要按规定缴纳。

个体户通常缴纳个人所得税，税率根据全年应纳税所得额适用5%至35%的五级超额累进税率。

请注意，税法规定可能会有更新，具体缴税方式和税率请以当地税务机关的最新规定为准。