药店需要上交的主要税种包括：

增值税：

药店销售药品属于应税销售行为，需缴纳增值税。税率通常为16%，但小规模纳税人可能适用不同的税率。

附加税费：

这包括城市建设维护税、教育费附加和地方教育费附加。附加税费通常以实际缴纳的增值税额为基础计算。

企业所得税：

药店盈利后需按照规定比例缴纳企业所得税。

个人所得税：

药店员工的个人收入，如工资、奖金等，达到一定标准后需要缴纳个人所得税。

其他税种：

可能包括印花税、土地使用税等。

具体的税率和缴税额度可能会根据药店的规模、地区以及当地税务部门的规定有所不同。药店会计应当注意遵守相关税法规定，并按时申报缴纳税款